Bio
En la actualidad soy Profesor Titular en el Departamento de Bioingeniería de la Universidad Carlos III de Madrid, donde lidero mi propia de línea de investigación desde 2013, con financiación pública propia, orientada al avance de sistemas de radiología. Parte de la financiación viene de convocatorias específicas del CDTI para fomentar la transferencia a la industria en colaboración con la empresa SEDECAL. A partir de esta colaboración se han instalado dos salas de rayos X avanzadas valoradas en más de 200.000 euros: una en la UC3M y otra en el Hospital Gregorio Marañón. A pesar de la juventud de esta línea, se han generado 6 artículos de revista con factor de impacto, 40 comunicaciones a congreso (25 internacionales), 3 registros de software y 1 patente española, PCT y actual solictud de patente europea.
Empecé mi carrera profesional trabajando durante más de 4 años en la industria de telefonía móvil (en TECSIDEL y ERICSSON ESPAÑA), participando en proyectos de I+D para el desarrollo de redes móviles GSM, GPRS y UMTS.
Mi vocación por la investigación, unida al interés en el tratamiento de imagen y a la búsqueda de una línea más orientada a contribuir en la mejora de los sistemas de salud, me llevó a reorientar mi carrera cuando encontré el grupo de imagen del Hospital Gregorio Marañón, que unía una amplia experiencia y producción científica con fuertes enlaces con personal clínico del hospital y con la industria. En 2005 obtuve una beca FPI del Ministerio de Educación y en 2010 presenté la tesis obteniendo sobresaliente Cum Laude y mención de Doctor Europeo.
Durante los primeros años mis principales contribuciones fueron en calibración y reconstrucción de imagen para sistemas tomográficos TAC, PET y SPECT. La mayor parte de los resultados de mi trabajo se han incorporado, bajo acuerdos de transferencia de tecnología, en tomografos de alta resolución distribuidos en todo el mundo por General Electric y SEDECAL.
He realizado 4 estancias colaborando con los principales grupos de investigación en reconstrucción de imagen sumando un total de 19 meses: Universidad de Washington, Lawrence Berkeley Lab., Universidad de Michigan y Universidad Vritje de Bruselas.
He publicado 19 artículos en revistas internacionales de alto impacto en el área dentro del primer tercil de su categoría (14 dentro del primer cuartil), 11 de ellos como primer autor y 3 como senior (último). He realizado 101 contribuciones a congresos; la mayoría de ellas, si bien no tienen JCR, son de alto impacto en el área, se incluyen habitualmente como referencias en artículos de revista y aparecen listados en el ISI Web Of Science. He participado en 38 proyectos de investigación competitivos con financiación pública, siendo IP en seis de ellos: 2 contratos de investigación y cuatro proyectos concedidos por el Ministerio de Economía y Competitividad (CDTI, INNPACTO y RETOS).
Gran parte de los resultados de mi actividad han sido transferidos a la industria dentro de proyectos financiados en convocatorias que promueven la transferencia a la industria. Entre ellos, tres algoritmos de reconstrucción, dos protocolos de calibración y tres algoritmos de compensación de artefactos fruto de mi trabajo se han incorporado, bajo acuerdos de transferencia de tecnología, en escáneres tomográficos de alta resolución comercializados por la empresa SEDECAL y distribuidos en todo el mundo por General Electric y SEDECAL. Los proyectos en los que soy IP en la actualidad se llevan a cabo en convocatorias de transferencia a la industria en colaboración con la empresa SEDECAL y los resultados serán incorporados a los equipos de imagen radiológica que la empresa comercializa en todo el mundo.
Colaboro en estudios de postgrado en la Universidad Nacional de Costa Rica, la Universidad Nacional de Colombia, la UNED, la UCM. Coordino 5 asignaturas del máster en Ingeniería Clínica de la UC3M. Soy miembro de la Junta de Escuela, miembro de la Comisión Académica del Grado de Ingeniería Biomédica, miembro de la comisión académica del programa de doctorado de Ciencia y Tecnología Biomédica y directora del Master de Ingeniería Clínica.
Teaching
Biomedical Engineering degree at UC3M (in english):
- From edition 2010/11: “Introduction to Bioengineering” (coordinator)
- From edition 2012/13: “Image processing and reconstruction”
- From edition 2013/14: “Instrumentation and multimodality imaging” (coordinator)
- From edition 2013/14: “Advanced topics in medical image”
Master in Information Master in Clinical Engineering:
- From edition 2013/14: "Tecnologías de imagen médica" (coordinator)
Master in Information Master in Information Health Engineering:
- From edition 2013/14: "Medical image reconstruction" (coordinator)
Mechanical Engineering degree at UC3M:
- Editions 2011/12 and 2014/15: “Repercusiones sociales de las nuevas técnicas de imagen biomédicas”.
From edition 2011/12: Master in Cardioimaging, Universidad Complutense de Madrid, Spain. Master courses: “Cardioimaging in reaserch” and "Multimodality imaging" (module cordinator).
June 2010: Visiting professor at the Physics Department, Faculty of Physics, Universidad Nacional de Costa Rica. Master course (32 hours): “Medical image analysis and image reconstruction”
May 2012: Visiting professor at the Physics Department, Faculty of Physics, Universidad Nacional de Costa Rica. Master course (40 hours): “Radiology, medical image analysis and image reconstruction”
August 2012: Visiting professor for the Master in Biomedical Engineering, Universidad Nacional de Colombia
Two editions of the post-graduate program “Postgrado en infraestructura, equipamiento y mantenimiento de establecimientos de salud”, Universidad Carlos III de Madrid. Module “Gestión de tecnología del equipamiento”.
June 2012: Master en Fisica Médica, Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED). Curso: “PET/CT”.
June 2014: Master en Fisica Médica, Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED), Spain. Curso: “PET/CT”.
June 2017: Master en Fisica Médica, Facultad de Ciencias de la Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED), Spain. Curso: “PET/SPECT/CT” y "Bases de la reconstrucción de imagen".
Selected publications
(En lo que sigue uso * para indicar que ambos autores contribuyeron por igual (2 primeros autores) y ζ para indicar Corresponding autor)
Serrano, J. García-Blas, J. Carretero, M. Desco, M. Abella, Accelerated Image Reconstruction for Low-dose Computed Tomography through Big Data Frameworks, Future generation, in press.
M. Abellaζ, J.J. Vaquero, M. Desco, Jeffrey A. Fessler, Simplified Statistical Image Reconstruction for X-ray CT with Beam-Hardening Artifact Compensation, IEEE TMI, 39(1):111-118, 2020.
A. Martínez, A. García-Santos, N. Ballesteros, M. Desco, M. Abella. XAP-Lab: A software tool for designing flexible X-ray acquisition protocols, Computer Methods and programs in biomedicine, 177, 243-252, 2019.
M. Abellaζ, C. de Molina, N. Ballesteros, A. Garcia-Santos, A. Martínez, I. García, M. Desco. Enabling tomography with low-cost C-arm systems, Plos One, 2018 (in press).
Pedro M. Gordaliza, Arrate Muñoz-Barrutia, Monica Abella, Manuel Desco, Sally Sharpe, and Juan José Vaquero. Unsupervised CT Lung Image Segmentation of a Mycobacterium Tuberculosis Infection Model, Scientific Reports, 8:9802, 1-10, 2018.
C. de Molina, E. Serrano, J. Garcia-Blas, J. Carretero, M. Desco and M. Abella. GPU-accelerated Iterative Reconstruction for Limited-Data Tomography in CBCT Systems, BMC Bioinformatics, 9:171, 2018.
M. Abella*ζ, E. Serrano*, J. Garcia-Blas, I. García, C. de Molina, J. Carretero, M. Desco. FUX-Sim: An implementation of a fast universal simulation/reconstruction framework for X-ray systems, Plos One, 12(7): e0180363, 2017.
J.F.P.J. Abascal*, M. Abella*ζ, E. Marinetto, J. Pascau, J.J. Vaquero, M. Desco, 2016, A novel prior- and motion-based compressed sensing method for small-animal respiratory gated CT, Plos One, 11:e0149841 (20 pag). Q1
J.F.P.J. Abascal*, M. Abella*ζ, A. Sisniega, J.J. Vaquero and M. Desco, Investigation of different sparsity transforms for the PICCS algorithm in small-animal respiratory gated CT, Plos One, 10(4), e0120140, 2015
J. Garcia Blas, M. Abella, F. Isaila, J. Carretero, M. Desco. Surfing the optimization space of a multiple-GPU parallel implementation of an X-ray tomography reconstruction algorithm, Journal of Systems and Software, 95, 2014, 166–175.
A. Sisniega, M. Abella, M. Desco and J. J. Vaquero, Dual exposure technique for extending the dynamic range of x-ray flat panel detectors, Physics in Medicine and Biology, 2014, vol. 59(2), 421-439.
M. Abellaζ, E. Vicente, S. España, E. Lage, J.J. Vaquero, J.M. Udias, M. Desco, Misalignments calibration in small-animal PETscanners based on rotating planar detectors and parallel-beam geometry, Physics in Medicine and Biology, vol. 57, 7493–7518, 2012
M. Abellaζ, D.A. Mankoff, L.R. MacDonald, J.J. Vaquero, M. Desco, P.E. Kinahan, Accuracy of CT-based attenuation correction in PET/CT bone imaging, Physics in Medicine and Biology, vol. 57, 2477-2490, 2012. (7 citations)
M. Abellaζ, A. Sisniega, J.J. Vaquero, A. Rodriguez, J. Pascau, I. Vidal, M. Desco, Software Architecture for Multi-Bed FDK-based Reconstruction in X-ray CT Scanners, Computer. Methods and programs in Biomedicine, 107, 218-232, 2012
E. Lage, J.J. Vaquero, A. Sisniega, S. España, G. Tapias, M. Abella, A. Rodríguez-Ruano, J.E. Ortuño, A. Udías and M. Desco, Design and performance evaluation of a coplanar multimodality scanner for rodent imaging, Physics in Medicine and Biology, vol. 54(18), 5427-5441, 2009
E. Lage, J.L. Villena, G. Tapias, M.L. Soto-Montenegro, M. Abella, A. Sisniega, N.P. Martínez, F. Pino, D. Ros, J. Pavía, M. Desco, J.J. Vaquero. A SPECT Scanner for Rodent Imaging Based on Small-Area Gamma Cameras, IEEE Transaction on Nuclear Imaging, vol. 57(5), 2524-2531, 2010
M. Abella, J.J. Vaquero, M.L. Soto-Montenegro, E. Lage, M. Desco, Sinogram Bow-Tie Filtering in FBP PET Reconstruction, Medical Physics, vol. 36 (5), 1663-1671, 2009
M. Abella, J.M. Zubeldia, L. Conejero, N. Malpica, J.J. Vaquero, M. Desco, Automatic quantification of histological studies in allergic asthma, Cytometry Part A, vol. 75(3), 169-171, 2009
J.J. Vaquero, S. Redondo, E. Lage, M. Abella, A. Sisniega, G. Tapias, M.L. Soto-Montenegro, M. Desco, Assessment of a New High-Performance Small-Animal X-Ray Tomograph, IEEE Transactions on Nuclear Science, vol. 55(3), 898-905, 2008
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Mónica Abella García Departamento de Bioingeniería e Ingeniería Aeroespacial Universidad Carlos III de Madrid Avda. de la Universidad 30 28911 Leganés - Madrid - Spain Phone: 916248194 / 914265067 e-mail: monica.abella@uc3m.es
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